У меня схожий вопрос, медленно работает магазин на woocommerce. было 11 тысяч товаров, всё было хорошо, стало 12 тысяч - грузится 3-7 секунд в среднем, пробовал отключать плагины, включать кеш на сервере, на сайте, обновил php и mysql до последней версии, настраивал php и mysql очень долго...