Поддержку WooCommerce прописал конечно же.
Может быть проблема в том, что я в некоторых местах вызывал сразу необходимые части шаблонов, игнорируя хуки? Например, там где в шаблоне мне нужно было вывести цену товара, я писал следующее: <? wc_get_template( 'single-product/price.php' ); ?>