Скорее всего через стили, а не в темплейте. Порядок элементов там задается через кучу мест, action'ами. В частности - в файле ...\wp-content\plugins\woocommerce\includes\wc-template-hooks.php идет ссылка на темплейт, который добавляет эту кнопку
add_action( 'woocommerce_after_shop_loop_item', 'woocommerce_template_loop_add_to_cart', 10 );